La sección de expedientes está formada por unidades documentales compuestas ordenadas cronológicamente por años. En esta sección encontramos testamentarias, registros de ganado, vino, indios, mercaderías y aguardiente. Asimismo, se encuentran algunos pleitos, reales provisiones, entre otros documentos.
La sección de protocolos del Archivo Notarial de Orizaba está compuesta por protocolos ordenados cronológicamente, los cuales contienen actas notariales igualmente ordenadas, de las que dieron fe los escribanos que radicaron en Orizaba, entre las actas encontramos poderes, compra-ventas, testamentos, codicilos, arrendamientos, dotes, donaciones, fundaciones de capellanías, libertades de esclavos, censos, depósitos, obligaciones de pago, cancelaciones, recibos de dinero, ratificaciones, cesiones, traspasos, división de bienes, renuncias, nombramientos.
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